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I Conceptos y metodos en el estudio de la filogenia. Bol. SEA, 26 |
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Juan José De Haro Resumen: Se describen los puntos más importantes de la teoría de la evolución y se examinan diversos autores que han influido de forma relevante, con su pensamiento o su obra, en la elaboración de la teoría de la evolución. Se describe también el momento histórico en el que Darwin y Wallace hicieron pública su teoría y las aportaciones posteriores más significativas a la misma. Palabras clave: Evolución, Darvinismo, Selección natural, Darwin, Wallace, Filogenia. The origin of the evolutive theories Abstract: The most important points of the theory of the evolution are described. We also examine diverse authors who have influenced, with their thought or his work, in the processing of the theory of the evolution. The historical moment at which Darwin and Wallace made their theory public is also described as well as the more significant later contributions to the same one. Key words: Evolution, Darwinism, Natural selection, Darwin, Wallace, Phylogeny.
Ernst Mayr Resumen: Se revisan los sistemas de clasificación biológica en atención a los criterios utilizados, comparándose el sistema de clasificación tradicional o darviniano con el resultante de la llamada ‘sistemática filogenética’ o cladificación. Ambos sistemas utilizan criterios y tienen objetivos diferentes, siendo la cladificación incapaz de producir una clasificación tradicional por diversas causas enumeradas. Palabras clave: Clasificación, Clasificación darviniana, Cladificación, Filogenia. Evolutionary Taxonomy Abstract: The different systems of biological classification are reviewed attending to the criteria on which they are based. The traditional or Darwinian system is compared with that resulting of the so called phylogenetic systematics or cladification. Both systems use different criteria and have different objectives, althouhh the cladification is unable to produce a traditional classification. The reasons of this failure are discussed. Key words: Classification, Darwinian classification, Cladification, Phylogeny.
5. Sobre Sistemática, Taxonomía y otros términos relacionados Juan M. Nieto Nafría Resumen: Taxonomía y Sistemática son términos referentes al estudio de la diversidad de la vida en la Tierra. Para algunos autores son sinónimos, mientras que para otros tienen significados diferentes, pudiendo haber entre ellos complementariedad, subsidiariedad o subordinación. Se considera también la significación de otros términos relacionados con ellos. Se analiza la situación y las repercusiones que las distintas interpretaciones pueden tener en la estimación de los científicos correspondientes. Palabras clave: Sistemática, Taxonomía, Biodiversidad, Filogenia, Faunística, Nomenclatura, Biología comparada, Clasificación, Sistematización, Cladificación. About Systematics, Taxonomy and others related terms. Abstract: Taxonomy and Systematics are terms which refer to the diversity of life. For some authors they are synonymous, while for others they have a different meaning, among them may be complementary nature, subsidiary nature or subordination. The meaning of other terms related to them is also taken into account. The situation and the repercussions that the different interpretations could have on the estimation of the corresponding scientist are analyzed. Key words: Systematics, Taxonomy, Biodiversity, Phylogeny, Faunistics, Nomenclature, Comparative Biology, Classification, Systematization, Cladification.
6. Métodos de análisis en la reconstrucción
filogenética Emilio J. López Caballero y Gonzalo Pérez Suárez
Resumen: Se realiza una breve exposición general de la historia de la clasificación biológica, describiendo los procesos intelectuales y científicos que, en cada época, marcaron el pensamiento y los criterios para clasificar los organismos. Se describen los principales caracteres utilizados en taxonomía, la variación de su importancia a lo largo del tiempo y su utilidad para cada sistema de clasificación y se hace un breve estudio critico de los tres principales métodos taxonómicos: Fenético, cladista y la sistemática ortodoxa o evolutiva. Se ha realizado una breve exposición de la metodología de reconstrucción filogenética y su forma de considerar los caracteres. Se define el concepto de homología y los criterios para su comprensión así como el concepto de parsimonia y los algoritmos de cálculo de los árboles filogenéticos utilizados por los principales programas informáticos de reconstrucción. Palabras clave: Clasificación, Taxonomía, Caracteres taxonómicos, Fenética, Cladismo, Sistemática evolutiva, Homología, Parsimonia, Cladograma, Árbol filogenético, Fenograma, Polarización, Compatibilidad. Analysis methods in phylogenetics reconstruction Abstract: We carried out a brief general exhibition of the history of the biological classification, describing the intellectual and scientific processes that marked the thought and the approaches to classify the organisms, in each time. The main characters used in taxonomy are described, the variation of their importance along the time and their utility for each classification system and a brief and criticise study is made of the three main taxonomic methods: Fenetist, cladist and the one orthodox or evolutionary systematic. We carried out a brief exhibition of the methodology of phylogenetic reconstruction and their form of considering the characters. The homology concept and the approaches for their understanding as well as the concept of parsimony and the algorithms of calculus of phylogenetic tree, used by the main computer programs of reconstruction, is defined. Key words: Classification, Taxonomy, Taxonomic characters, Phenetic, Cladism, Evolutionary systematic, Homology, Parsimony, Cladogram, Phylogenetic tree, Phenogram, Polarity, Compatibility.
7. Cladismo: La reconstrucción filogenética basada en parsimonia Miquel Àngel Arnedo Dirección actual: Division of Insect Biology, ESPM
Palabras clave: Reconstrucción filogenética, Terminología cladista, Ponderación de los caracteres, Búsquedas de árboles, Fiabilidad de los cladogramas, Árboles de consenso, Análisis combinado. Cladistics: Phylogenetic reconstruction based on parsimony Abstract: The cladistic framework has become the dominant paradigm for phylogenetic reconstruction. Here, I review and discuss its basic tenets and philosophical justification. Cladistics is characterized from other systematic schools by separating derived homologies (synapomorphies) from primitive (plesiomorphies), and by using only the former as valid characters for grouping taxa. Current approximations to phylogenetic reconstruction can be distinguished by their criteria for recognizing synapomorphies. Under parsimony the preferred hypothesis minimizes the number of character transformations. Cladistic analyses consist of a series of subsequent stages that include taxon sampling, construction of the character matrix, search for the most parsimonious tree and assessment of the reliability of the selected phylogenetic hypothesis. Special attention is paid to hotly debated issues such as character weighting and the analysis of characters from different sources. Key words: Cladistics, Phylogenetic reconstruction, Cladistic terminology, Character weighting, Tree search, Cladogram reliability, Consensus trees, Combined analyses.
Gonzalo Nieto Feliner Resumen: A pesar de ser el método más ampliamente usado en reconstrucción filogenética, la Cladística no dispone de una síntesis conceptual que sea aceptada por las distintas corrientes que la componen. A partir del origen de esta escuela de Sistemática, el autor destaca algunos de los hitos que han marcado su desarrollo y diversificación, y comenta las desviaciones más significativas respecto a las ideas y métodos que en cada momento se consideraban mayoritarios dentro del Cladismo. Se señalan, además, algunos de los mitos atribuidos frecuentemente a la Cladística así como las controversias más debatidas en la actualidad. Palabras clave: Cladística, Hennig, Sistemática. Three decades of Cladistics Abstract: Despite being the most widely used method in phylogeny reconstruction, Cladistics lacks a generally agreed conceptual synthesis. Starting from its foundation, the author gives an overview of the development and diversification of this school of Systematics, and comments the major departures from the mainstream ideas and practice. Some of the most pervasive myths attributed to Cladistics, as well as the issues that are most hotly debated in the last years, are also discussed. Key words: Cladistics, Hennig, Systematics.
9. Un programa de investigación nunca emprendido : la inferencia filogenética como test psicométrico Borja Sanchiz Resumen: Se presenta la inferencia filogenética a la manera del test psicométrico. Con esta analogía, los ítems del test son equivalentes a los caracteres, sus respuestas alternativas a los estados de carácter, y los sujetos son análogos a las distintas hipótesis evolutivas (dendrogramas) posibles con los taxones que se analizan. La conveniencia de establecer para estudios filogenéticos diversos instrumentos de medida válidos y fiables, de uso estandarizado, sería el fundamento sobre el que desarrollar este programa de investigación conceptual nunca emprendido en Biología. Un ejemplo práctico, basado en una secuencia molecular, muestra algunas posibles aplicaciones de los modelos psicométricos tradicionales a la selección y codificación de caracteres biológicos, y prueba que este acercamiento es tanto factible como deseable. Palabras clave: Psicometría, Tests, Fiabilidad, Validez, Cladismo, Filogenia. An unprecedented research program: phylogenetic inferences using psychometric test tools Abstract: The phylogenetic inference is presented as a psychometric test. In this analogy, the items of this test are the characters, their alternative answers are the character-states, and the persons are all the evolutionary hypothesis (dendrograms) that are possible for the taxa analized. The basic premise for the development of this unprecedented research program in Biology is the need to establish standarized, accurate and reliable measuring instruments for phylogenetic studies. A practical example, based on a molecular sequence, demonstrates some applications of the traditional psychometric models to the selection and coding of biological characters and proves that this approach is both feasible and desirable. Key words: Psychometry, Tests, Reliability, Validity, Cladistics, Phylogenetics.
Juan José de Haro Resumen: Se discuten los diferentes conceptos de especie: linneano, fenético, evolutivo y filogenético. La especie es concebida por el autor del trabajo como un grupo de organismos que evolucionan conjuntamente, capaces de mantener su propia identidad diferenciada de la de otros grupos. Las subespecies aparecen en los estadios iniciales de la cladogénesis y su destino es incierto, pudiendo ser absorbidas por la especie originaria o bien, formar una especie diferente por consolidación de la cladogénesis. Por este motivo se sugiere que las subespecies son hipótesis sobre cladogénesis. Palabras clave: Concepto de especie, Linneano, Fenético, Evolutivo, Filogenético, Metaespecies, Subespecies. What is a specie? Abstract: Different species concepts are discussed: Linnaean, phenetic, evolutionary and phylogenetic. The species is conceived like a group of organisms that evolve jointly, able to maintain its own identity differentiated from other groups. The subspecies appear in the initial stages of the cladogenesis and its destiny is uncertain, being able to be absorbed by the original species or, to form a different species by consolidation of the cladogenesis. For this reason we suggests them as hypothesis about cladogenesis. Key words: Species concept, Linnaean, Phenetic, Evolutionary, Phylogenetic, Metaspecies, Subspecies. |
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3.
El origen de las teorías evolutivas
Resumen: La metodología denominada cladismo o cladística se
ha convertido en el paradigma de la reconstrucción filogenética. En el
presente articulo se revisan y comentan sus principios básicos y su
justificación filosófica. El cladismo se caracteriza frente a otras escuelas
sistemáticas por distinguir las homologías derivadas (sinapomorfías) de las
primitivas (plesiomorfías), y utilizar solo las primeras como caracteres
válidos para la agrupación de taxones. La forma en que estas sinapomorfías
son reconocidas, distingue las principales aproximaciones actuales a la
reconstrucción filogenética. La parsimonia es un criterio para la selección
de hipótesis filogenéticas alternativas, bajo el cual la hipótesis preferible
es la que minimiza el número de transformaciones adicionales de los caracteres.
El análisis cladístico consiste de una serie de etapas sucesivas, que
incluyen: la selección de los taxones de estudio, la construcción de la matriz
de caracteres, la búsqueda de los árboles más parsimoniosos y la evaluación
de la fiabilidad de la hipótesis filogenética escogida. Se presta una especial
atención a dos temáticas que son actualmente objeto de un acalorado debate: la
ponderación de los caracteres y el análisis de datos de distinta naturaleza.
